Le modèle du LMD est organisé sur un répertoire de base. Ce répertoire est associé à la variable d'environnement LMDGCM. L'exemple ci-dessous montre l'affectation de cette variable en csh sous UNIX pour la version de référence du modèle au LMD.
setenv LMDGCM /users/lmdz/SOURCES/LMDZ.2.2
Voici très sommairement le contenu de ce répertoire.
lmdz.2/ cray/ Fichiers necessaires pour faire tourner le modele sur le cray. libf/ Ensemble des Sources FORTRAN du modele (.F pour cpp) et Fichiers include (.h) organises en sous repertoires (physique, dynamique, filtres ...). create_make_gcm Executable servant a la creation du makefile. Cette commande est executee automatiquement par "makegcm" (voir plus loin).